Solo quería comentar que yo siempre he oído hablar de «maratoniano». Nunca antes había oído la palabra «maratonista». Al parecer, se usa más en Latinoamérica.
¡Hola, Olga!
Yo diría que valen las dos. La Fundéu, como casi siempre, nos saca de dudas. 
HTTPS://WWW.FUNDEU.ES/RECOMENDACION/MARATONIANO/
¡Gracias por el aporte!
Pablo